醫學部現有腦科學與疾病研究院、轉化醫學研究院、營養與健康研究院、創新藥物研究院、數字醫學與計算機輔助手術研究院、代謝病研究院、腫瘤精準醫學研究院、神經再生與康復研究院、生物醫學研究院、干細胞再生醫學研究院、慢病研究院、運動醫學與健康研究院、生殖醫學研究院、生物醫用材料與工程研究院共計14個研究院。
醫學部現有臨床醫學、醫學檢驗學、醫學影像學、兒科學、預防醫學、口腔醫學、藥學、護理學8個本科專業。臨床醫學為國家特色專業和省重點專業，2002年2月教育部批準該專業招收7年制（現為5加3一體化臨床醫學專業）學生。醫學影像專業、醫學檢驗專業為省級特色專業。